A második körben már jobban érvényesült a papír forma egy-két mérkőzést eltekintve.

Az első kisebb meglepetés a Franciaország-Mexikó (0-2) mérkőzésen adódott. A Argentína jó játékkal 4-1-re verte Dél-Koreát. Anglia meglepetésre csak 0-0 ért el Algéria ellen. Az első forduló utáni jó játék után meglepetésre kikapott Németország Szerbiától 0-1-re, igaz Klose már a mérkőzés elején mehetett az öltözőbe. Ghána meglepetésre 1-1-et játszott Ausztráliával. A Hollandia és a Dánia is nyert az E. csoportban. Olaszország kinkeservesen játszott 1-1-et Új-Zéland legjobbjaival. Brazília és Portugália is simán nyert a "Halál csoportban", a brazil mérkőzésen kb. 15 percig a szabálytalanságon volt a hangsúly valamint Kaká kiállítása nem volt jogos. Chile nehezen nyert Svájc ellen, Spanyolország pedig nagyobb különbséggel is verhette volna Honduras csapatát D.Villa még 11-est is hibázott.

A második kör után biztos továbbjutó: Hollandia és Brazília.

A második körben a csapatok 43 gólt rúgtak (majdnem kétszer annyit mint az elsőben). A bírok pedig 69 sárga lapot és 5 piros lapot osztottak ki a 16 mérkőzésen.