Muldert és Scullyt az egyik társuk, Jerry Lamana keresi fel, aki jelenleg fel van függesztve, mert nem megfelelően vezetett egy fontos nyomozást. Lamana elmondja, hogy Benjamin Drake, az Eurisko vállalat alkalmazottjának meggyilkolásának ügyében nyomozott. Drake-t halálos áramütés érte egy ismeretlen személy által felállított csapdából, aki feltehetőleg jól ismerte a az Eurisko központi vezérlő rendszerét ( COS ). Lamana a két ügynökre bízza az ügyet.

Az Euriskoban Peterson építészmérnök elmondja, hogy azon kevesek egyike, aki hozzáférhet a COS-hoz, Brad Wilczek, a cég alapítója és Drake halálos ellensége. Hangelemző készülékkel analizálva Scully kideríti, hogy Wilczek eltorzított hangon felhívta Drake-t közvetlenül a gyilkosság előtt és ezzel döntő szerepet játszott a csapda működtetésében.

Lamana elindul az Eurisko épületébe, hogy letartóztassa Wilczeket. Amikor azonban a lift eléri a 29. emeletet, váratlanul megáll, majd visszazuhan és becsapódik a talajba.

Mulder eközben megtudja Deep Throat-tól, hogy Wilczek komoly kutatásokat végez a mesterséges intelligenciák kifejlesztése terén. Habár Wilczeket végül letartóztatják Drake és Lamana meggyilkolásáért, Mulder ártatlannak hiszi a férfit. A börtöncellájában Wilczek elárulja Muldernek, hogy COS egy intelligens gép. Véleménye szerint COS végzett Drake-el, amikor rájött, hogy ki akarja kapcsolni.

Mulder ráveszi Wilczeket, hogy írjon egy számítógép-vírust, ami lekapcsolja a rendszert. A két ügynök, a vírussal, eléri az Eurisko épületét és behatolnak. COS azonban számított rájuk és ellenük fordítja a ház elektromos berendezéseit. Peterson segítségével Mulder bejut a vezérlőterembe, ám mielőtt betehetné a lemezt, Peterson fegyvert szegez rá. Kiderül, hogy a a Védelmi Minisztériumnak dolgozik és szüksége van a számítógép mesterséges intelligenciájára. Scully időben jön Mulder segítségére és lefegyverzi Petersont. Mulder betölti a vírust és COS örökre kikapcsol... vagy mégsem?

Ghost in the machine #1X06

Eredeti bemutató: 1993. október 29.

Írta: Howard Gordon és Alex Gansa

Rendezte: Jerrold Freedman

Fox Mulder - David Duchovny

Dana Scully - Gillian Anderson

Deep Throat - Jerry Hardin

Jerry Lamana - Wayne Duvall

Steven Wilczek - Rob Labelle

Claude Peterson - Blu Mankuma

Benjamin Drake - Tom Butler